1958年,东莞县档案馆成立,负责对全县档案收集、整理、保管、提供利用和对档案工作进行业务指导。
1985年,东莞撤县设市,原县档案局、县档案馆改称市档案局、市档案馆,市档案局与市档案馆实行局馆合一体制。
2004年,市档案局(馆)搬迁到市行政办事中心,并建立内部办公系统,逐步实现局务馆务由手工方式向现代化管理方式转变。
2012年,市档案局(馆)正式进驻档案大楼,20多万卷档案全部安全运抵新档案馆,实现档案零污染、零丢失、零涉密的目标。
2019年,根据《东莞市机构改革方案》精神,市档案局调整为在市委办公室挂牌,市档案馆作为市委直属事业单位。2019年1月22日,市档案馆正式挂牌。
为充实我馆馆藏,根据2019年档案征集工作安排,8月27日至30日,由我馆李振球、巫业通、李剑锋等3人组成征集组,到南京市档案馆和中国第二历史档案馆征集刘纪文及与东莞相关的档案资料。
征集组一行,先后到南京市档案馆、中国第二次历史档案馆2个单位查阅档案资料,找到并复印了刘纪文任南京特别市市长时期相关档案资料一批,这些资料反映了国民党时期刘纪文被国民政府委任为南京市特别市长政务活动资料。